Importante uso de la biología molecular: detección de tuberculosis en horas

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Una de la enfermedades más antiguas que ha aquejado al hombre es la tuberculosis (TB), se estima que tiene una antigüedad de 15.000 a 20.000 años. Esta enfermedad infecciosa es causada por una bacteria, más específicamente un  bacilo, que pertenece al genero de las micobacterias: Mycobacterium tuberculosis.

A principio de los años ochenta se pensó que esta enfermedad estaba a punto de estar erradicada y que dejaría de ser un problema de salud pública,  sin embargo actualmente esta enfermedad infecciosa es una de las principales causas de muerte en el mundo, siendo declarada como una emergencia global. Aquí algunos datos que muestran el porque de esta declaración (OMS):

  1. El número estimado de nuevos casos baciliferos de TB en 2006 fue de 9,2 millones (139 por 100 000 habitantes), entre ellos 4,1 millones de nuevos casos (44% del total) y 0,7 millones de casos VIH-positivos (8% del total).
  2. La cifra estimada de casos de tuberculosis multirresistente en 2006 fue de 0,5 millones de casos.
  3. La cifra estimada de defunciones por tuberculosis en 2006 fue de 1,7 millones, incluidos 0,2 millones de personas infectadas por el VIH
  4. Se estima que hay 30 millones de personas infectadas en el mundo

Además de propagarse de manera más fuerte que en épocas pasadas, la TB es cada vez más resistente al tratamiento antibiótico disponible: TB  multirresistente (MDR), y TB extremadamente resistente (XDR); personas infectadas con este tipo de TB solo cuentan con opciones de tratamiento que son mucho menos eficaces que los tratamientos de primera línea, y a menudo presentan resultados poco favorables.

Dos de los hechos que vienen favoreciendo la diseminación y aumento de la epidemia de TB, son el retraso en el diagnóstico y el deficiente estudio de contactos, hechos que tienen como  consecuencia que  personas infectadas no sean tratadas y sigan diseminando la enfermedad.

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Detección molecular del dengue: diagnóstico preciso en Rep Dominicana

Quienes hemos sufrido y/o vivimos en áreas en donde estamos expuestos a contraer dengue, sabemos que el diagnóstico temprano es fundamental para un adecuado manejo, seguimiento y tratamiento; en muchas ocasiones  el diagnostico de dengue durante los primeros dias, puede hacer la diferencia entre la vida y la muerte. De manera tradicional cuando una persona tiene síntomas de dengue se hacen una serie de pruebas (hemogramas, conteo plaquetas, detección de anticuerpos, etc…) que pueden dar indicio de la infección (ya que no detectan el virus, sino posibles respuestas del cuerpo) y que pueden variar mucho entre una y otra persona.

http://www.imgm-index.de/images/rna_isolation.jpgSin embargo, después de años de estudios y gracias a los avances de la biología molecular y la virología, ha sido posible desarrollar técnicas directas para la detección del dengue basadas en la amplificación y detección del material genético del virus. La tecnología molecular en la detección y estudio del dengue ha venido implementándose en países donde esta enfermedad es una prioridad (endémicos) como Brasil, Cuba, India, Filipinas entre otros, y para confirmar casos ¨importados¨ en Estados Unidos; la buena noticia es que ahora  la República Dominicana tiene a su disposición esta tecnología de punta para detectar la infección por dengue.

En ese sentido, es para mi de gran satisfacción formar parte del equipo del Centro de Estudios Moleculares (CEM)  que pone a disposición de toda la población dominicana la Detección molecular del virus del dengue, prueba que permite hacer un diagnóstico de dengue dentro de los cinco primeros dias de iniciados los síntomas, altamente sensible y específica, ya que se basa en la amplificación del genoma del virus.

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Para ver el brochure completo puede hacer click aquí

Algunas de las ventajas son:

  1. Es una prueba altamente sofisticada que permite detectar el virus en la sangre de una persona dentro de los cinco primeros dias de iniciada la infección.
  2. Este método presenta el más alto grado de sensibilidad y especificidad, ya que se amplifica y detecta el virus del dengue.
  3. Se presenta un resultado positivo al inicio de la fase sintomática de la infección, mientras las pruebas inmunológicas deben hacerse después de quinto o sexto día de iniciados los síntomas, dependiendo de la respuesta inmune propia de cada persona.
  4. Solo se requiere una muestra de sangre, otras pruebas indirectas requieren de dos o más muestras en diferentes dias.
  5. Se detecta la infección por cualquiera de los cuatro serotipos del dengue.

Para más información puede llamar a: 809 688 0641en  Santo Domingo y  809 582 2136  en Santiago

 


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JOVE: experimentos cientifícos on-line

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El internet y las nuevas tecnologías vienen revolucionando la forma de comunicar en el mundo,  las ciencias no son la excepción, favoreciendo un escenario más abierto, flexible y transparente. Una de estas novedosas formas de comunicación científica es JOVE (Journal of Visualized Experiments), algo como un ¨you-tube¨ enfocado en las ciencias de la vida.

Actualmente la palabra escrita y la imagen estática habitual que se observan en las revistas tradicionales, parecen no ser suficientes para transmitir con precisión la evolución de la investigación moderna.

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Descubren familia de virus que ¨infectan¨ a otros virus

http://www.nature.com/nrmicro/journal/v6/n4/images/nrmicro1858-f1.jpgEl fascinante mundo de los virus no deja de sorprendernos. En los últimos dias investigadores franceses descubrieron una cepa de un mimivirus gigante, denominado mamavirus, que infecta un tipo de ameba (Acanthamoeba),  pero aún más interesante fue lo encontrado junto a él: otro tipo de virus  pequeño adjunto que utiliza la maquinaria genética  que el mamavirus ha tomado en la ameba para su propio beneficio.

A este pequeño virus se le ha dado el nombre de Sputnik (nombre primer satélite que se puso en el espacio), y se cree que puede ser considerado un ¨virófago¨, debido a la similitud con los bacteriófagos o fagos (virus que infectan bacterias),  ya que Sputnik utiliza la maquinaria del virus gigante (mamavirus) añadiéndole sus genes  que son copiados junto con los del mamavirus, cuando esto ocurre el proceso de replicación del  virus gigante se ve truncado y se para, algo así como que el virus es ¨infectado¨y se ¨enferma¨.

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Evolución molecular del virus del dengue: mucho por investigar y descubrir

El dengue es actualmente,  la enfermedad más importante entre las virales transmitidas por artrópodos, y constituye una prioridad en salud pública en los países tropicales y subtropicales, siendo probablemente después de la malaria la más relevante. Después de la segunda guerra mundial, se ha expandido a casi todo los territorios tropicales y subtropicales del mundo, y últimamente amenaza con establecerse en área no tropicales.

http://www.phac-aspc.gc.ca/tmp-pmv/2007/gfx/dengue_map06sm_e.gif

http://www.utmb.edu/discoveringdenguedrugs-together/dengue%20virus-1THD.jpgEl dengue es una infección viral, causada por arbovirus, específicamente por cuatro flavivirus cercanamente relacionados, DEN-1 DEN-2. DEN-3 y DEN-4. Los cuatro serotipos pueden producir indistintamente un cuadro clínico que varía desde una forma leve,   fiebre de dengue o dengue clásico (DC), hasta una condición severa: fiebre hemorrágica por dengue o dengue  hemorrágico (DH), o síndrome de choque por dengue (SCD). Este virus es transmitido al hombre por mosquitos vectores, principalmente Aedes aegypti.

De acuerdo con la OPS una de las líneas de investigación estratégicas en la lucha contra el dengue, es  el estudio de las características moleculares del virus del dengue (VD), desde identificación de serotipos circulantes hasta la epidemiología molecular y evolución del VD, y su relación con el impacto que tienen en cada país o región afectada.

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Nueva tecnología destruye bacterias patógenas en alimentos

http://www.cdc.gov/foodsafety/images/FIGHTBAC.JPGInvestigadores de la universidad de Georgia (UGA) han desarrollado una tecnología efectiva para reducir la contaminación de peligrosas bacterias en los alimentos. El nuevo sistema destruye rápidamente Salmonella y E. coli O:157:H7 en alimentos como lechugas, tomates, frutas y productos avícolas; de acuerdo con sus creadores se trata de compuestos de bajo costo y reconocidos como seguros por la FDA (Food and Drug Administration).

El CDC (Center of Diseases Control) estima que solo en Estados Unidos, los patógenos alimentarios causan 76 millones de enfermos al año. De quienes son afectados 300.000 son hospitalizados y 5.000 mueren. Esta diseminación de brotes de infecciones transmitidas por alimentos se debe en parte a el rápido sistema de distribución de alimentos. El caso más reciente es el tomate crudo que causo un brote de salmonellosis que afecto más de 300 personas en 28 estados y Canadá.

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Microbiología: El paso de lo¨tradicional¨ a lo ¨molecular¨

http://www.microbiology.org.uk/images/Listeria%20sp.jpgHace un par de años en una charla acerca de nuevas tecnologías en microbiología, presencie y participe en un debate que se planteó entorno a la afirmación de que los métodos moleculares y la tecnología reemplazarían los métodos tradicionales de hacer microbiología en muchas áreas (clínica, alimentos, industrial, ambiental, etc…).

Quienes afirmaban que los métodos tradicionales se quedarían en el largo plazo y que probablemente algunas cosas podrían trabajarse a la par, argumentaban que a pesar de que nuevas tecnologías son muy útiles, versátiles, rápidas, efectivas y con grandes ventajas en sensibilidad y especificidad sobre los métodos tradicionales, las metodologías moleculares no podrían implantarse debido a su costo.

http://biology.kenyon.edu/BMB/mbio3.jpgEn este momento me pareció algo coherente, teniendo en cuenta que en nuestros países en desarrollo no existen grandes presupuestos para desarrollo y tecnología, los sistemas son un poco precarios, y a veces lo urgente no permite resolver lo importante, sin embargo, hoy creo que este argumento del costo es relativo.

Es claro, que en principio la introducción de nuevas tecnologías, como estrategias moleculares, con todas las ventajas que tienen sobre métodos desarrollados a principios del siglo pasado, representa dinero, tiempo, infraestructura, entrenamiento y capacitación de personal. Sin embargo, si se hace un análisis más allá de lo inmediato, a mediano y largo plazo se puede observar que es un asunto de costo-beneficio.

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PCR en tiempo real. Una de las mejores herramientas moleculares.

Desde que el controvertido premio nobel Kary Mullis en 1986 describió la PCR (Polymerase Chain Reaction), poderosa herramienta en biología molecular, sin la cual no se hubiesen logrado avances en la ciencia tales como el proyecto genoma humano, el descubrimiento de genes asociados a enfermedad, y la identificación de nuevos agentes infecciosos; tal vez el mayor avance que se ha logrado es el desarrollo de la real time PCR o PCR en tiempo real ( rT-PCR, qRT-PCR, PCRrt).

http://www.dnsffaa.gub.uy/GCU/adn3.gifLa reacción de PCR en si, se refiere a la amplificación enzimática de un fragmento de ácido nucleico (DNA o RNA). El montaje de una PCR tradicional requieren tres partes: extracción y purificación del DNA o RNA (Pre-PCR), la amplificación o PCR en si (anidada, múltiplex, asimétrica, asociada a transcripción reversa, etc…), y la visualización (post-PCR). Es decir, una vez finalizada la amplificación (PCR) como tal, se deben realizar diferentes procesos para hacer la detección y/o cuantificación de los productos de amplificación (amplicones), por lo que este tipo de reacción se considera de punto final, presentado algunas desventajas.

En la búsqueda de una reacción que permitiera cuantificar la cantidad de ácidos nucleicos al tiempo que se realizaba su amplificación, se desarrolló la rT-PCR, denominada en principio PCR cinética (Higuchi, 1993).

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Virus, un reto para la taxonomía

http://micro.magnet.fsu.edu/cells/viruses/images/bacteriophage.jpgLa virología, una ciencia relativamente joven pero cuyo avance en los últimos 20 años ha sido vertiginoso, ha ido revelando muchas de las característica de estos seres, los virus; algunos dan una definición simple, un ácido nucleico envuelto en proteínas, otros los han definido como la brecha entre lo inerte y lo vivo.

A través del estudio de los virus se han revaluado varias teorías consideradas casi dogmas en las ciencias:

  • El DNA es la única molécula que puede contener la información genética, después del descubrimiento de los virus RNA este concepto tuvo que cambiarse.
  • La información génetica fluye de DNA-RNA-Proteínas, también gracias al descubrimiento de los retrovirus se comprobó que puede fluir en sentido de RNA-DNA y/o RNA-proteína directamente.

Esta área de las ciencias ha resultado un desafío para nosotros, acostumbrados a clasificar. Esta es la tarea del International Committee for Taxonomy of Viruses (ICTV). La cual considera a los virus como biosistemas elementales con algunas características de los seres vivos, esto es:

  1. Los virus tienen genes, se replican, evolucionan, se adaptan a los hospederos y al ambiente, sin embargo, no pueden generar, capturar y almacenar energía, por lo que no son funcionales fuera de las células hospederas.
  2. Aunque son patógenos, no se pueden considerar microorganismos patógenos, ya que no son seres vivos.
  3. Un virus pasa a ser parte de un sistema vital cuando infecta una célula y su material genético se integra a esta. [Continuar leyendo →]


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Las arqueas, nueva fuente de antibióticos.

http://www.espacial.org/images/jpg2/arqueas.jpgLas arqueas, microbios descubiertos hacia el año 1977, pertenecen un mundo casi completamente inexplorado. A pesar de ser procariotas, están más cerca a nosotros los eucariotas en el árbol de la vida que a las bacterias, fueron descubiertos en 1977. Antes de conocer su existencia teníamos una clasificación de reinos, después de que los estudios comprobaron que aunque son microbios, no son bacterias, ni algas, se hizo una nueva clasificación y ahora tenemos tres dominios, por lo que el descubrimiento de estos microbios, entre muchas cosas cambio las relaciones de parentesco entre los seres vivos.

http://ablogios.mundodisco.net/wp-content/uploads/2007/12/phylogenetic_tree-es.png

Estos organismos que se conocen como ancestrales y extremos por su capacidad de vivir en ambientes con altas concentraciones de sal y ácido, a más de 80°C, y sin oxigeno, representan un nicho metabólico inexplorado. Se ha descrito que estos muchos de estos microbios son capaces de producir ¨arqueocinas¨, sustancias que equivaldrían a las bacteriocinas (péptidos con acción antibacteriana) producidas por las bacterias para defenderse de otras especies.

Estos compuestos se han encontrado principalmente en las haloarqueas (arqueas que pueden vivir a altas concentraciones de sal). A pesar de los inconvenientes que se presentan para la recuperación y caracterización de arqueocinas, se cree que dentro este grupo de sustancias producidas por las arqueas, hay oportunidad de encontrar antibióticos con actividad clínica, teniendo en cuenta que a pesar de los esfuerzos en el desarrollo de nuevos antibióticos en los últimos años, los resultados no han sido exitosos.


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No queremos guerra. Pasa la bola

Pasa la bola

En este espacio hoy quiero compartir la propuesta que nace de Victor Solano, como respuesta a situación que se ha generado en los últimos días, entre Colombia, Ecuador y Venezuela, en la que se ha nombrado varias veces la palabra guerra; y que tiene en vilo no solo a los ciudadanos que pertenecemos algunos de estos tres países, sino a toda Latinoamérica y al mundo.

Amigo colombiano, ecuatoriano y venezolano:

  • Vamos a demostrar que los lazos que unen a nuestros pueblos de Ecuador, Colombia y Venezuela son más fuertes que los egos de nuestros gobernantes.
  • Vamos a demostrar que condenamos el terrorismo y respetamos la soberanía
  • Vamos a demostrar que ningún gobierno nos va obligar a dispararle a un hermano de nuestros países.
  • Vamos a demostrar que somos más, muchos más los que no concebimos a Latinoamérica en guerra
  • Vamos a demostrar que pese a la historia, no estamos condenados a ella
  • Vamos a demostrar que nuestras diferencias son nuestro valor, que nuestra diversidad es nuestra riqueza
  • Vamos a demostrar que hoy germina una generación que anhela crecer en paz

“Pasa la voz, pasa la bola”


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Enfermedades tropicales serán problema para el primer mundo?

Publicado en la edición del 24 de febrero de Listin Diario, en Lecturas de Domingo, República Dominicana

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Cuando se habla del trópico se hace referencia a esta parte del mundo cuyo clima se caracteriza por fuertes lluvias, elevadas temperaturas y humedad relativa alta, condiciones que favorecen el desarrollo de una gran biodiversidad; en este complejo ecosistema diferentes especies de animales y plantas sirven de reservorio y vectores para una variedad de microorganismos.

En este ambiente sobreviven y se diseminan un heterogéneo grupo de microorganismos –parásitos, bacterias, hongos y virus- patógenos (capaces de producir enfermedad), son los agentes causantes de las denominadas enfermedades infecciosas tropicales.

Estas infecciones han sido un problema casi exclusivo de los países que se encuentran en esta área del mundo, la malaria, el dengue, la leishmaniasis, la enfermedad de Chagas, la filariasis, la leptospirosis, entre muchas otras son endémicas en más de 100 países ubicados en esta parte del globo, sin embargo, en los últimos años se han venido observando cambios en el comportamiento de las enfermedades circunscritas a esta área del mundo, el más importante, la posible diseminación de muchas de ellas más allá del área tropical. [Continuar leyendo →]


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Costa Rica y Colombia, países latinos con mejor desempeño ambiental

De acuerdo con los resultados de Indice de Desempeño ambiental, EPI 2008 (Environmental Performance Index), realizada a 149 países, Costa Rica y Colombia, se encuentran dentro de los diez primeros lugares, ocupando el quinto y noveno puesto respectivamente; por encima de naciones desarrolladas como Estados Unidos (No 39), Alemania (No 13), Japón (No 21), Holanda (No 55). El primer lugar fue para Suiza, otros países latinos como Brasil y Argentina ocuparon la posiciones 34 y 38 respectivamente.

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Este estudio, realizado por un grupo de expertos ambientales de la Universidad de Yale y Columbia, fue presentado en el Foro Económico Mundial 2008, en Davos (Suiza), al cual asisten más de 2500 participantes, 30 jefes de estado, personajes como Al Gore, Bill Gates y Bono.

Para la evaluación del desempeño se tuvo en cuenta indicadores en los siguientes aspectos: contaminación atmosférica, contaminación de aguas, salud ambiental, biodiversidad y habitat, manejo de recursos hídricos, recursos naturales y cambio climático.

El fin del EPI es identificar objetivos de desempeño ambiental, y dar un indicador de que tanto los diferentes países se acercan al cumplimiento de dichos objetivos, es una herramienta que ofrece datos analíticos concretos y sólidos, que favorecen la toma de decisiones de política publica, en torno al aspecto ambiental.


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Flora intestinal, probióticos y prebióticos ….

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Publicado en la edición del 6 de enero de 2008 del Listín Diario, Lecturas de Domingo, República Dominicana

Escuchamos términos como probiótico, prebiótico y flora intestinal, haciendo referencia a ¨algo saludable¨, sin embargo, a veces desconocemos qué son en realidad y porqué son tan beneficiosos para la salud.

Cuando hablamos de probióticos no referimos a microorganismos vivos, bacterias, que ingeridas en cantidades adecuadas producen efectos beneficiosos para la salud más alla de los inherentes al valor nutricional. Un prebiótico, en cambio, es un carbohidrato no digerible, que tiene la capacidad de favorecer el crecimiento de dichas bacterias beneficiosas.

Para muchos resulta un poco extraño relacionar el consumo de microorganismos con algo saludable, ya que generalmente asociamos la presencia de bacterias, con infección y enfermedad. Situación entendible, ya que las enfermedades infecciosas (causadas por microorganismos) han sido una de las principales causas de mortalidad, siendo responsables de más muertes que todas las guerras de la humanidad juntas. Pero en el vasto mundo microbiano, los organismos causantes de enfermedad corresponden a la menor proporción, una gran cantidad de ellos son beneficiosos y necesario para nuestra salud, viviendo como nuestros ¨huéspedes¨.

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Mal uso de los antibioticos (gripes y resfriados)

http://www.museudavida.fiocruz.br/publique/media/gripe.jpgHace algunos días sufrí un resfriado, algo ¨normal¨, dolor de garganta, malestar general, algo de dolor de cabeza, etc.., para mitigar un poco los síntomas tomé los consabidos antigripales, para así sentirme mejor.

El problema es que cada vez que me da un episodio de estos, tengo un ¨debate¨con algunos amigos y familiares, con relación a porqué no tomo ninguna de las diferentes ¨fórmulas especiales¨ que ellos me recomiendan con muy buena intención para acabar con la gripe; las cuales pueden incluir: doble dosis de antigripales, antialérgicos, y en la mayoría de las ocasiones dos o tres pastillas de algún antibiótico.

http://www.drugdevelopment-technology.com/projects/t705/images/1-influenza-virus.jpg Y porqué no tomo antibióticos para la gripe o el resfriado?

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